Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms