Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms