Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms