Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC061212Q6P8K3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC061212Q6P8K3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms