Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RbfaQ6P3B9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RbfaQ6P3B9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms