Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Pkp4Q68FH0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pkp4Q68FH0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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