Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltcQ68FD5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms