Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms