Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga3Q62470 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga3Q62470 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms