Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms