Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms