Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms