Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atxn7l3bQ3UD01 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atxn7l3bQ3UD01 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atxn7l3bQ3UD01 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atxn7l3bQ3UD01 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atxn7l3bQ3UD01 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atxn7l3bQ3UD01 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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