Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms