Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ap5b1Q3TAP4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ap5b1Q3TAP4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms