Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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