Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo3bQ1EG27 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms