Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms