Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms