Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms