Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SnrpfP62307 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms