Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c39P56656 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2c39P56656 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2c39P56656 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2c39P56656 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2c39P56656 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2c39P56656 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2c39P56656 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2c39P56656 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c39P56656 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c39P56656 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c39P56656 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms