Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lim2P56563 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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