Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrlP54846 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrlP54846 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NrlP54846 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms