Protein–RNA interactions for Protein: P53368

Nudt1, 7,8-dihydro-8-oxoguanine triphosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt1P53368 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt1P53368 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt1P53368 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt1P53368 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt1P53368 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt1P53368 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt1P53368 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt1P53368 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt1P53368 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt1P53368 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt1P53368 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt1P53368 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt1P53368 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt1P53368 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt1P53368 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt1P53368 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt1P53368 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nudt1P53368 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt1P53368 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms