Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpdP50404 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms