Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VdrP48281 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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VdrP48281 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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VdrP48281 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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VdrP48281 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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