Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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