Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms