Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms