Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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