Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VimP20152 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VimP20152 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VimP20152 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VimP20152 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VimP20152 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VimP20152 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VimP20152 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VimP20152 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VimP20152 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VimP20152 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms