Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl4P14097 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms