Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP11369 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP11369 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP11369 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms