Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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