Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms