Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TcraP01849 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TcraP01849 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TcraP01849 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TcraP01849 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TcraP01849 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TcraP01849 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TcraP01849 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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