Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms