Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn5O54942 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn5O54942 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms