Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Limk2O54785 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limk2O54785 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Limk2O54785 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms