Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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