Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaluO35887 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaluO35887 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaluO35887 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms