Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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