Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Efna3O08545 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Efna3O08545 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Efna3O08545 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Efna3O08545 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Efna3O08545 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Efna3O08545 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Efna3O08545 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Efna3O08545 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Efna3O08545 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Efna3O08545 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms