Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm21900J3QP38 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm21900J3QP38 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm21900J3QP38 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm21900J3QP38 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm21900J3QP38 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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