Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20828J3KMI7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms