Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms