Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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