Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms