Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms